На данный момент собраны данные 1390 мужчин из пяти городов (Архангельска, Новосибирска, Кемерово, Улан-Удэ, Якутска), представляющих три этноса - славян, бурят и якутов. Общая схема базы данных РПМ представлена на рисунке 1.
Рисунок 1. Общая схема базы данных "Репродуктивного потенциала мужского населения России"
Таблица Trips содержит информацию об экспедициях, в рамках которых были собраны информация об феноме мужчин.
Поле | Комментарий |
---|---|
Id_Trip | Идентификатор экспедиции |
Town | Город |
Year | Год, в котором была проведена экспедиция |
Comments | Дополнительная информация об экспедиции |
Таблица Men содержит фенотипических данные мужчин, в том числе антропометрические показатели; уровни тропных и стероидных гормонов; пептидного гормона семенников; показатели качества эякулята; показатели обмена веществ; результаты обследования андролога; данные о перенесенных урологических заболеваниях.
Поле | Комментарий |
---|---|
Id_man | Номер, под которым фигурировал мужчина во время проведения экспедиции. |
Expedition_Id | Экспедиция, в рамках которой была собрана информация. |
Nationality | Национальность |
Age | Возраст |
Mass | Вес |
Height | Рост |
WC | Окружность талии |
HC | Окружность бедер |
BMI | Индекс массы тела |
TV | Тестикулярный объем |
SystolicBP | Систолического артериального давления |
DiastolicBP | Диастолического артериального давления |
SA | Количество дней сексуального воздержания |
Ejaculation | Объем эякулята |
CountS | Общее количество сперматозоидов |
ConcentrationS | Концентрация сперматозоидов в эякуляте, подсчитанная с использованием камеры Горяева |
MotilityS | Доля подвижных сперматозоидов |
MorphologyS | Доля морфологически нормальных сперматозоидов |
TZI | Индекс тератозооспермии |
LH | Уровень лютеинизирующий гормон |
FSH | Уровень фолликулостимулирующий гормон |
T | Уровень тестостерона |
E2 | Уровень эстрадиола |
InhibinB | Уровень ингибина B |
Triglycerides | Уровент триглицеридов |
Cholesterol | Уровень общего холестерина |
HDL | Уровень липопротеинов высокой плотности |
LDL | Уровень липопротеинов низкой плотности |
Glucose | Уровень глюкозы |
UricAcid | Уровень мочевой кислоты |
Andrologist | Диагноз андролога |
Diseases | Список перенесенных заболеваний, которые могли повлиять на репродуктивные функции |
DFI | Индекс фрагментации ДНК сперматозоидов |
AZF | Тип микроделеции AZF локуса Y хромосомы |
CAG | Количество CAG-повторов в экзоне 1 гена рецептора андрогенов AR |
Таблица Sperm содержит более детальную информацию об эякулята добровольца.
Поле | Комментарий |
---|---|
Id_variant | идентификатор варианта комбинации дефектов спермотозоида в эякуляте |
Man_id | номер, под которым фигурировал мужчина во время проведения экспедиции |
Trip_id | идентификатор экспедиции |
FormHeadAbn | наличие дефекта формы головки. Варианты значений:
|
SHeadAbn* | – наличие дефекта размеров головки. Варианты значений:
|
DoubleHead* | наличие двух головок у сперматозоида |
VacuolatedHead | Головка содержит более двух вакуолей и/или вакуоли занимают более 20% от площади головки и/или хотя бы одна вакуоль любого размера расположена в постакросомальной зоне |
AcrosomeAbn | наличие дефекта размеров акросомной области, при котором ее площадь меньше 40% или больше 70% площади головки |
BentHead | наличие сильной изогнутости средней части по отношению к длинной оси головки |
ERC | наличие чрезмерной резидуальной цитоплазмы. Имеется резидуальная цитоплазматическая капля, площадь которой 1/3 и более от площади головки. |
AsymmetNeck | наличие дефекта средней части, при котором место ее прикрепления находится в стороне от линии оси головки |
WMidpieceAbn | наличии дефекта ширины средней части. Варианты значений:
|
DoubleTail | наличие множества хвостов у сперматозоида |
CoiledTail | наличие скрученной формы хвоста |
ShortTail | наличие аномально короткого хвоста (Длина хвоста менее 45 мкм) |
Count | Количество сперматозоидов с такими же характеристиками (вариантом) в эякуляте добровольца |
* - дефект не выделяется в отдельную группу в рекомендациях Всемирной организации здравоохранения (WHO, 2010), поэтому не отображается в интерфейсе к базе данных. |
База данных RPM реализована с помощью СУБД MySQL, инсталлированной на Web-серверах ЦКП «Биоинформатика» ИЦиГ СО РАН.